魟鱼的常见疾病主要有细菌性感染、寄生虫感染、肠胃炎、细菌性鳃病、白头白嘴病、鳃霉病、水霉病等等。主要是受到水质环境，饮食饵料等因素的影响。
魟鱼头部凹陷通常是由于缺氧、感染或其他一些疾病引起的，如果及早治疗，仍有可能挽救魟鱼。治疗方法包括使用抗生素来治疗感染、增加氧气供应、维持良好的生态环境等。然而，如果魟鱼头部凹陷已经过深并影响到了其生命机能，恢复可能较为困难。因此，对于魟鱼头部凹陷的治疗应该尽早进行，以提高治疗的成功率。
魟鱼是胎盘动物，怀孕时间与鱼类不同，而是像哺乳动物一样孕育子嗣。通常怀孕时间为8-10个月，但有些品种如大白鲨的怀孕时间长达18个月。魟鱼在怀孕期间经历着肥大的变化，不合适的环境会对其生育造成不良影响。幼鱼生下来后会留在母亲身边一段时间，吸收卵黄囊的营养，之后会逐渐独立。即使如此，现在魟鱼的数量正在急剧减少，需要重视保护与管理。