如果员工在工作中发生交通事故，导致工伤，医药费应该由用人单位承担。因为这是在工作过程中发生的意外伤害，属于工伤范畴。用人单位应当按照国家规定参加工伤保险，为本单位全部职工缴纳工伤保险费。
如果用人单位未按时缴纳工伤保险费，发生工伤的，由用人单位支付工伤保险待遇。因此，员工的医疗费用应由用人单位承担，而不是由员工自己承担。
根据中国刑法规定，交通肇事罪的刑期一般为3年以下有期徒刑、拘役或者罚金；情节严重的，刑期为3年以上7年以下有期徒刑。妨害公务罪的刑期一般为3年以下有期徒刑、拘役或者罚金；情节严重的，刑期为3年以上10年以下有期徒刑。具体的判决结果还需根据被告人的犯罪情节、社会危害程度、认罪态度等因素综合考虑。