综合所得个人所得税的计算方式为：综合所得应纳税额=(收入额-6万元-专项扣除-专项附加扣除-其他扣除)*税率-速算扣除数1。其中，综合所得包含工资薪金所得、劳务报酬所得、稿酬所得和特许权使用费所得2。具体计算公式为：应退或应补税额=[(综合所得收入额-60000元-“三险一金”等专项扣除-子女教育等专项附加扣除-依法确定的其他扣除-符合条件的公益慈善事业捐赠)×适用税率-速算扣除数]-已预缴税额3。个人所得税税率根据综合所得和经营所得分别适用不同的超额累进税率4。
综合所得预扣预缴申报表填写时需要注意以下几点：
其次，根据所得种类填写不同的税表，并核实预扣预缴税额和已缴税额是否一致。
最后，填写纳税人签字及日期，并记得在申报时附上相关证明文件。如果有任何疑问，应及时联系相关税务机构或税务专业人士求助。